Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01654 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01654 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01654 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01654 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01654 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01654 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01654 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01654 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01654 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01654 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01654 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01654 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01654 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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