Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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CcnkO88874 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CcnkO88874 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CcnkO88874 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnkO88874 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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