Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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ComtO88587 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ComtO88587 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ComtO88587 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ComtO88587 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ComtO88587 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ComtO88587 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ComtO88587 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ComtO88587 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ComtO88587 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ComtO88587 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ComtO88587 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ComtO88587 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ComtO88587 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ComtO88587 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ComtO88587 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ComtO88587 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms