Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp8O70404 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms