Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DffaO54786 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms