Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna4O35343 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms