Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casp6O08738 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casp6O08738 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casp6O08738 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms