Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17078M0QW51 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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