Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3542K7N6U2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3542K7N6U2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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