Protein–RNA interactions for Protein: J3QN86

Gm21882, Predicted gene, 21882, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21882J3QN86 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21882J3QN86 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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