Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20834J3QM72 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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