Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28048F7BCN0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm28048F7BCN0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28048F7BCN0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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