Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1110002E22RikE0CYV9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms