Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf11bB4XVQ1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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