Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Phf11cB4XVP9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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