Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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PtprbB2RU80 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PtprbB2RU80 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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