Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfc3h1B2RT41 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfc3h1B2RT41 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfc3h1B2RT41 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfc3h1B2RT41 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfc3h1B2RT41 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfc3h1B2RT41 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfc3h1B2RT41 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfc3h1B2RT41 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfc3h1B2RT41 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfc3h1B2RT41 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms