Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm6880A3KG45 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm6880A3KG45 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm6880A3KG45 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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