Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam43bA2AM80 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Fam43bA2AM80 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam43bA2AM80 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms