Protein–RNA interactions for Protein: A2AKQ8

Ttc30a2, Tetratricopeptide repeat protein 30A2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a2A2AKQ8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc30a2A2AKQ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms