Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a3A2ACT7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms