Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm3880A0A1B0GSB3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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