Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms