Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pdzd4Q9QY39 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd4Q9QY39 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pdzd4Q9QY39 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pdzd4Q9QY39 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pdzd4Q9QY39 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd4Q9QY39 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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