Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall2Q9QX96 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sall2Q9QX96 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms