Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms