Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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