Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms