Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms