Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig1Q9D2J4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms