Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms