Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyc1Q9D0M3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyc1Q9D0M3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms