Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxxc1Q9CWW7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms