Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhobtb3Q9CTN4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms