Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prps2Q9CS42 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prps2Q9CS42 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prps2Q9CS42 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prps2Q9CS42 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms