Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chchd1Q9CQA6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms