Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms