Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms