Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scd3Q99PL7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms