Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcam1Q99NB3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms