Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Prss29Q99MS4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Prss29Q99MS4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prss29Q99MS4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms