Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms