Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms