Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms