Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms