Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf19Q99KP6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms