Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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