Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms