Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncbQ91ZZ3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms