Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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